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超级显微镜探索大脑神秘 走进清华大学成像与智能技能


发布日期:2021-05-31 20:35   来源:未知   阅读:

  超级显微镜探索大脑神秘

  走进清华大学成像与智能技术实验室

  当一段音乐响起,大脑中哪些神经元会活跃起来?又是哪些神经环路在起作用?

  中风前后,脑血管中免疫细胞流量有何变革?

  癫痫的病理发活气制是什么?

  ……

  近日,记者走进清华大学成像与智能技巧实验室,探访如何通过显微仪器多维度、多尺度探索大脑的神秘。

  据了解,清华大学成像与智能技术实验室戴琼海团队于2018年研制出高分辨光场智能成像显微仪器(英文简称RUSH)。该仪器在国际上首次实现音乐刺激下苏醒小鼠全脑皮层范围神经网络活动的高速成像,使得上述问题在实验动物身上得到更深一步的研究。

  仪器是科学研究的“先行官”。可以说,该仪器的出生带来一系列连锁反应,极大促进了脑科学的研究与发展,并有助于推动人工智能的发展。

  当初,RUSH仍然是国际上视场最大、数据通量最高的介观光学显微仪器,它也因此被称为“超级显微镜”。

  1 超大体积 占用三个房间,仪器主体有一人多高

  5月13日下战书,在位于清华大学主楼7层的成像与智能技能实验室里,记者见到了这台发现了数个国际之“最”的显微仪器,“大”是记者的第一感想。

  不同于那些可以“拿起来就走”的传统显微镜,这台“超级显微镜”包括了3000多个自主设计、国内生产的光学、机械、电子部件,仅主体局部就要独自有用一个房间。

  房间内,两个长约2.5米、宽约1.5米的实验台呈90度直角放置,上面分辨架设着一个一人多高的黑色金属外壳。“这是为了防止实验过程中可能浮现的光辉搅扰等。”仪器研发团队成员、清华大学自动化系副研究员范静涛告诉记者,进行实验时,该房间温度、湿度、清洁度等都有严格的操纵尺度。

  掀开一侧的金属外壳,记者看到,一个实验台上架设着显微仪器的物镜系统、光源系统和成像系统,另一个实验台上架设着另外一组照明系统。

  物镜系统相称于相机的镜头。RUSH的物镜体积非常大。个别光学显微镜的物镜比一节一号电池略小,而RUSH的物镜体积是一般光学显微镜的900倍。物镜下是一个六足的六自在度位移台,拍摄对象就是固定在这里。

  “两组光源体系通过数字盘算可进行一系列反射、折射,为拍摄小鼠大脑照明,相称于拍摄时的灯光,确保每一个角落都能被看清。”据范静涛先容,得益于此,该仪器能够实现空间维度、光谱维度等多维度智能成像。

  仪器中很多部件都是柔性的,研究人员可能根据实验须要进行自由组合。

  在仪器旁边的桌子上,放置着多少台电脑。“这一台是仪器的控制系统,比喻这个位移台怎么移动、什么时候开始拍、什么时候停止,等等,都通过这台电脑把持。”范静涛指着其中一台电脑告诉记者。说罢,他又指着另一台电脑说:“这一台是显示系统,拍摄的画面可以在这个屏幕上实时显示。”

  然而,这个在记者眼中已觉十分巨大的主体部分却是该仪器中最小的一块。据介绍,RUSH整体共占了三个房间,除了显微仪器主体外,冷却机、数据计算和存储平台还分别占用了一个房间。

  在水冷机房,记者看到了4台冷却机。据介绍,仪器工作时会发热,要想持续失掉比较好的成像品德,温度把持十分主要。“通常是控制在10摄氏度左右,靠的就是这4台冷却机,它们通过管线与像感器相连接,借助流水带走热量。”范静涛告诉记者。

  水冷机房隔壁的隔音玻璃房,就是数据计算和存储机房。这是RUSH最大的一部分,占地约50平方米。

  2 超宽视场 兼顾厘米级视场和百纳米辩白率,既“看得宽”又“分得清”

  在生活中,一平方厘米对咱们而言,很小,只有指甲盖般大小。但在脑迷信范畴,一平方厘米却很大,大到可以覆盖小鼠全脑皮层,领有成千盈百亿个神经元。

  借助RUSH,研究职员可以看到小鼠全脑皮层范围的单个神经元,从而揭示其神经网络的活动法则。也就是说,该仪器既可看“点”、又可观“面”,既可观测细节、又可观测系统,这奠定了RUSH视场最大介观光学显微仪器的国际位置。

  脑是人类意识自然的“最后疆域”,揭示神经环路的活动法令是理解脑结构跟高级功能的必由之路。然而,大脑有成千盈百亿个神经元,每个神经元又包含千余个信息收发分支,由于观测仪器的制约,无奈获得观测对象的活体全脑高分辨率动态成像数据,数十年始终制约着相关研究取得重大冲破。

  传统的微观电镜成像,可以观测到神经细胞的精巧结构,但无奈实现活体观测;宏观功效核磁可以观测动态脑区级功能活动,但因为分辨率不够高,看不到神经细胞。因而,戴琼海团队一开端便瞄准了“介观标准高通量显微仪器”这一研讨方向,目的是实现超宽视场、超高分辩率、超快成像速度,要看得宽、分得清、拍得快、存得下。基于试验动物小鼠大脑直径1厘米、神经元构造微米级、神经运动毫秒级的特点,研发团队将视场跟辨别率目标分辨设为厘米级、亚微米级。

  要攻克的重要艰苦是解决视场与分辨率之间彼此制约的固有抵触。

  “以传统显微镜为例,当我们想要看得清的时候,观测范畴势必很小;当咱们想要大视线规模时,又要捐躯掉分辨率。”范静涛告诉记者,导致这种抵牾出现的起因是,现有成像仪器是在“物面和像面均为平面”的前提下进行设计的。实际上,平面物体的空想光学成像是曲面的,且视场越大,像面弯曲程度越高。为了配合平面成像传感器,校正像面曲折会使得周边变“虚”。

  团队另辟蹊径自行设计了适应像面波折的宽视场物镜系统,提高了光学信息的获取才干。这一独创设计正是RUSH仪器能统筹“看得宽”与“分得清”的关键。另一方面,通过像感器矩阵实现并行的数据采集、传输、存储与重建,再融共计算照明,使得视场、分辨率、帧率、数据通量综合指标均处于国际当先地位。

  “曲面像感器阵列”是一个由多个像感器组成的矩阵,每个像感器对应视场中的不同区块,拍摄曲面旁边像中近似平面的一小部门,最终拼接成一个整体显示出来。因其形似,而被团队成员亲切地称为“红烧肉”。

  “一代仪器是由35个像感器组成的阵列,二代仪器升级为28个像感器阵列。”范静涛介绍。

  2017年诞生的第一代RUSH,视场大小为1厘米×1.2厘米、分辨率为800纳米,每帧图像达到1.69亿像素,也就是说一帧图像可以铺满24个4k电视。目前,第二代RUSH已实现了1平方厘米的视场、近400纳米的分辨率,拍下的每帧图像有3.36亿像素。

  3 超高数据通量 相称于一秒钟可下载7部3G大小的片子

  RUSH不仅看得宽、分得清,而且还拍得快,是国际上数据通量最高的介观光学显微仪器。“第二代RUSH的数据通量超过了100亿像素/秒,是世界上排名第二的双光子随机扫描显微镜的980多倍。”范静涛告知记者。100亿像素/秒大略是什么概念?“相当于一秒钟可以下载7部3G大小的高清电影。”

  如此惊人的数据通量如何“存得下”?该仪器还有一套专门的数据计算和存储设备集群,单独占用了一个房间。该集群分两侧排列,一侧是打算单元,通过实时计算判断需要保留的数据,并将其储存至另一侧的存储单元,供研究人员随时察看研究。记者懂得到,该集群目前可存储11000TB图像信息。

  作为目前国际上首次实现小鼠全脑皮层范围神经活动高分辨率成像的仪器,RUSH已经实现良多翻新性实验,在生命科学、医学等领域发挥了重要作用。

  比如,借助RUSH实现清醒小鼠在气流刺激胡须下的全脑结构和功能成像,研究大脑功能信号和脑血管舒张是否存在关系;多尺度观察小鼠脑部免疫细胞的迁徙进程,帮助医学家等研究人体的免疫保护机理;深入摸索癫痫病理发生机制;结合人工智能实现脑胶质瘤病理切片原发灶/转移灶高通量瞬拍与分析;打造基于高通量成像的药物筛选平台,加速药物研制;利用RUSH发展神经网络机制研究,为人工智能超越发展供应新途径……

  创新仍在连续!以RUSH为研究起点,清华大学成像与智能技术实验室研发团队已研制出系列仪器。(本报记者 王珍) 【编辑:黄钰涵】